Seit 1998, als er den Jost Thöne Verlag gründete, hat Thöne ein Dutzend großer Bücher über die italienischen und französischen Geigenbauer der letzten vier Jahrhunderte veröffentlicht. In diesen Nachschlagewerken werden mehr als 120 dieser wichtigen Geigenbauer mit ihren Instrumenten und Biografien vorgestellt.

Das letzte dieser Werke war "Antonio Stradivari", das 2010 veröffentlicht wurde; es wurde zum "State of the Art" der Geigendokumentation und zeigt in vier Bänden 300 Geigen, Bratschen und Celli der Ikone Antonio Stradivari in Lebensgröße. Diese Dokumentation hat internationale Anerkennung gefunden.

Einige der Bücher wurden neben Englisch in vier weitere Sprachen übersetzt und werden bereits weltweit verkauft, zum Beispiel von internationalen Auktionshäusern wie Sotheby's, Christies oder Tarisio in London und New York.
Jost Thöne gründete 2006 die Violin Expo Cologne und schuf damit eine weltweit einzigartige Bühne für die Präsentation des internationalen zeitgenössischen Geigenbaus in der Kölner Altstadt. Als Gastkurator des Wallraf-Richartz-Museums & Stiftung Corboud betreute er 2010 die Ausstellung "Antonio Stradivari - Mythos und Musik" in Köln. Diese Ausstellung wurde leider aufgrund von Kürzungen des Kulturbudgets der Stadt Köln verschoben.